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无锡市生物计算工程技术研究中心

作者:  编辑:汪有维   发布日期: 2015-04-28   来源:


无锡市生物计算工程技术研究中心(简称“中心”)以江南大学理学院生物信息学研究方向为基础,依托江南大学工业生物技术教育部重点实验室,中国高校工业微生物资源平台,发酵技术国家工程中心和分子计算方面的研究团队,由无锡市科技局于2012年6月批准建设。本中心是以数学建模和大数据处理为工具来进行生物大分子计算、结构模拟及生物信息处理,将数学、生命科学、计算科学等学科进行交叉运用,它的良好运行将起到示范作用。

中心聘请了在生物信息学研究领域的著名专家,中国科学院上海生命科学研究院研究员,中国科学院系统生物学重点实验室执行主任,博士生导师陈洛南研究员和北京师范大学生命科学学院博士生导师林魁教授担任顾问。中心现有3个研究方向,20余名研发人员,其中高级职称12名,博士研究生16名。目前办公面积300平方米,实验室面积500平方米,试验检测面积600余平方米,试验检测设备价值达350余万元。近三年承担国家、省部级项目20余项,总经费700余万元,已在国内外著名刊物IEEE Transactions on Fuzzy Systems,Mathematics and Computers in Simulation,International Journal of Biomathematics, Applied Mathematics and Computation, Neurocomputing等SCI杂志上发表论文40余篇,其中单篇论文影响因子最高达5.484。 

一、 研究方向

建立疾病控制与药物疗效系统分析平台

主要建立分子结构基础上的基因调控作用的数学模型,利用生物组织分子内在的多层次关联的数学模型来诠释其蛋白质的结构,对多种观测与实验数据进行重构与分析,用以寻找和发现疾病基因的作用范围和突变区域,引入功能基因组与重要性状相关基因的研究;通过对基因组数据库的建立和应用,开展分布式生物数据库体系构建、实验数据与分析相关分子生物学数据整合及系基因组数据库系统技术研究建立多因素基因调控网络、表观遗传网络、信号转导通路和生化代谢途径的预测、分析、重构、建模技术和软件开发。这将在化学水平上解释遗传因子在各种疾病,如癌症等一些严重危害人类健康的疾病中的作用。

建立环境生态治理与生态评价平台

主要在研究蓝藻生物钟的基础上,瞄准国际生物钟研究的前沿,期望促进生物钟理论模型的基础研究,在应用上可以为其他模式生物的生物钟研究提供思路和有效经验,建立和完善环境生态治理与生态评价平台。为太湖蓝藻污染的治理提供理论依据和应用指导,逐步建立蓝藻生物治理技术产业。

建立生物发酵过程控制平台

针对生物发酵过程的具体特点,对发酵过程的现场数据进行采集、处理及完成控制功能;并通过高速、可靠而开放的系统分析,实现与上层信息管理系统的实时连接;实现生物发酵过程的优化控制和安全操作,生成友好的人机界面;实时、安全、可靠地对生物发酵过程实行监督、控制和优化,逐步建立生物发酵过程控制平台。

二、 部分项目

《基于粒计算理论的生物网络结构建模、分析与算法研究》国家自然科学基金面上项目(编号:11371174),2014.1-2017.12,62万,主持人:唐旭清,在研;

《地下水动力学模型分析和模拟与仿真试验研究》科技部国际科技合作重点项目“地下大型空间建造与周边环境监测和控制技术及装备引进(编号:2011DFR70500)子课题,2012.1-2016.12,105万,主持人:唐旭清,在研;

《p53抑癌基因分子调控机制的数学建模及其算法研究》国家自然科学基金面上项目(编号:11271163),2013.1-2016.12,68万,主持人:朱平,在研;

《蓝藻生物钟的数学建模及模拟》国家自然科学基金青年项目(编号:10901073),2010.1-2012.12,17万,主持人:胡满峰,已结题;

《基因调控网络的数学建模理论、方法与应用》中央高校基本科研业务费专项(编号:JUSRP51317B),2013.1-2015.12,80万,主持人:胡满峰,在研;

《面向特殊蛋白信号肽序列的模糊智能新算法研究》国家自然科学基金青年项目(编号:61402202),2015.1-2017.12,25万,主持人:高翠芳,在研;

《随机动力系统的混沌同步研究》国家自然科学基金青年项目(编号:11202084),2013.1-2015.12,23万,主持人:胡爱花,在研;

《CAD中混合拟Bézier曲线的整体几何特征分析及应用研究》国家自然科学基金青年项目(编号:61402201),2015.1-2017.12,26万,主持人:沈莞蔷,在研;

《CAD中拟Bernstein-Bézier三角曲面的理论及应用研究》江苏省自然科学基金青年项目(编号:BK20130117),2013.7-2016.6,20万,主持人:沈莞蔷,在研;

《CAD中变次数B 样条升阶性质及应用研究》国家自然科学基金天元项目(编号:11326243),2014.1-2014.12,3万,主持人:沈莞蔷,已结题;

《几类不适定问题的正则化理论及算法》江苏省自然科学基金青年项目?(编号:BK20130118),2013.7-2016.6,20万,主持人:程浩,在研;

 《分数阶扩散方程反向问题的正则化理论与算法研究》国家自然科学基金天元项目(编号:11426117),2015.1-2015.12,3万,主持人:程浩,在研;

三、代表性论著

Xu-Qing Tang and Ping Zhu, Hierarchical clustering problems and analysis of fuzzy proximity relation on granular space, IEEE Transactions on Fuzzy Systems,21(5), 814-824, 2013. (SCI)

Yong-Qing Yang, Jin-De Cao, Xian-Yun Xu, Man-Feng Hu and Yun Gao, A new neural network for solving quadratic programming problems with equality and inequality constraints, Mathematics and Computers in Simulation, 101, 103-112, 2014. (SCI)

Yong-Qing Yang, Jin-De Cao, , Xian-Yun Xu and Jiao Liu, A generalized neural network for solving a class of minimax optimization problems with linear constraints, Applied Mathematics and Computation, 218(14), 7528–7537, 2012. (SCI)

Cheng-Jie Tan, Shan-Shan Li and Ping Zhu, 4D Graphical representation research of DNA sequences, International Journal of Biomathematics, 8(1), 1550004, 2015. (SCI)

Man-Feng Hu, Liu-Xiao Guo, Ai-Hua Hu and Yong-Qing Yang, Leader-following consensus of linear multi-agent systems with randomly occurring nonlinearities and uncertainties and stochastic disturbances, Neurocomputing, 149, 884-890, 2015. (SCI)

Man-Feng Hu, Jin-De Cao, Ai-Hua Hu, Yong-Qing Yang and Ying-Hua Jin, A Novel Finite-Time Stability Criterion for Linear Discrete-Time Stochastic System with Applications to Consensus of Multi-Agent System, Circuits, Systems, and Signal Processing, 34(1): 41-59, 2015. (SCI)

Jie Gao, Ling Zhang and Pei-Xuan Jin, Forecasting Influenza Epidemic based on Mutation Probability of HA/NA Protein, Journal of Pure and Applied Microbiology, 7(2), 1251-1254, 2013. (SCI)

Jie Gao, Ling Zhang and Pei-Xuan Jin, Influenza Pandemic Early Warning Research on HA/NA Protein Sequences, Current Bioinformatics, 9(3), 228-233, 2014. (SCI)

Ai-Hua, Hu, Jin-De Cao, Man-Feng Hu and Liuxiao Guo, Cluster synchronization of complex networks via event-triggered strategy under stochastic sampling, Physica A: Statistical Mechanics and its Applications, 434, 99-110, 2015. (SCI)

Wan-Qiang Shen, Guo-Zhao Wang and Ping Yin, Explicit representations of changeable degree spline basis functions, Journal of Computational and Applied Mathematics, 238, 39-50, 2013. (SCI)

Hao Cheng,  Chu-Li Fu, Guang-Hui Zheng and Jie Gao, A regularization for a Riesz-Feller space-fractional backward diffusion problem, Inverse Problems in Science and Engineering, 22(6), 860-872, 2014. (SCI)

四、 部分活动

(1)中心成员学术交流会

(2)中科院陈洛南教授作报告 

(3) 中心成员考察

(4) 大型服务器

五、联系方式

通讯地址:江苏省无锡市蠡湖大道1800号江南大学理学院

邮政编码:214122

负责人:朱 平

联系人:程 浩

联系电话:0510- 85329094

传真:0510-85910532

E-mail:chenghao@jiangnan.edu.cn